FC手游之所以做得不好，主要原因可以归纳为以下几点：

盈利模式不匹配：

FC时期的游戏盈利模式主要是靠卖软件，而手机游戏的盈利模式是充值。FC游戏复刻到手机上后，不能让厂商盈利，因此开发商对移植FC游戏到手机平台并不积极。

市场需求和玩家偏好：

日本玩家对网游一直不是很热衷，而手机游戏的盈利模式依赖于玩家的充值，这与FC时期的盈利模式有很大不同。此外，日本市场上有任天堂的NDS和SONY的PS等便携游戏机，这些平台已经复刻了许多FC游戏，使得手机平台上的FC游戏需求相对较低。

技术限制：

FC游戏在硬件和软件设计上存在诸多限制，如手柄操作手段简陋、游戏难度设置不合理、缺乏场外信息和提示等。这些限制在手机平台上难以完全克服，导致移植后的游戏体验大打折扣。

游戏设计问题：

FC游戏的设计理念与现代手游有很大差异。FC游戏难度普遍较高，很多游戏难度设定不合理，导致玩家体验不佳。同时，FC游戏在剧情和画面方面的投入较多，以弥补玩法上的不足，这种设计理念在手机平台上难以实现。

平台竞争：

手机平台上的游戏种类繁多，竞争激烈，而FC游戏在市场上的份额相对较小，难以吸引大量玩家。此外，手机平台上的游戏更新迭代速度较快，而FC游戏一旦复刻，很难跟上市场的变化和玩家的需求。

综上所述，FC手游之所以做得不好，主要是由于盈利模式不匹配、市场需求和玩家偏好、技术限制、游戏设计问题以及平台竞争等多方面原因。